전교조는 지난달 23일 PC통신에 올린 '교총서명 대응 지침'을 통해 "교총의 교육부장관 퇴진서명은 흔들리는 교사들의 정서를 이용해 자신들의 기득권을 유지하려는 교활한 의도이자 교육개혁을 저지하려는 술수"라며 "전교조 조합원들은 서명에 동참하지 말고 일반 교사들의 불참을 설득하자"고 주장했다.
전교조는 이 지침에서 "교총의 장관 퇴진운동은 연금법 개악파동에 따른 교단내의 동요를 전문직단체를 고수하면서 단체교섭권을 확보하여 조직을 보존하려는 정략적 차원의 전술"이라고 규정하고 "보수적인 주요 일간지 등 언론도 교총의 퇴진운동에 긍정적인 반응을 보인다"고 분석했다.
전교조는 또 교총서명에 대한 투쟁방침으로 '교원 사기진작을 위한 교원정책특별위원회' 구성을 제안하고 전교조의 교원정책안중 관철해야 할 부분을 중심으로 교사 대상의 선전사업을 전개하는 한편 교육부장관과의 면담을 요청, 전교조가 교육현안 문제를 해결해 나가려는 의지가 있다는 점을 부각키로 했다.