서울의 고등학교에 학군 개념이 생긴 것은 고교 평준화가 도입된 1974년부터다. 당시 서울의 후기 일반계고는 모두 6개의 학군으로 묶였다.

이중 1개는 도심의 종로구, 중구 고교와 용산구 관내 45개 고교를 묶은 공동학군으로 서울 전역에서 학생 누구나 지원할 수 있었다. 나머지 5개 학군은 1학군(도봉ㆍ성북), 2학군(동대문), 3학군(성동), 4학군(용산ㆍ영등포ㆍ관악), 5학군(서대문ㆍ마포) 등이었다.

이듬해 5학군 소속 고교 중 지금의 서대문구 소재 고교 일부와 은평구 소재 고교를 분리해 6학군이 신설됐다.

또 1976년 4학군에 소속돼 있던 지금의 영등포구, 구로구, 강서구, 양천구, 관악구, 동작구 소재 고교를 분리하고 이들을 묶어 7학군을 뒀다.

이와 함께 공동학군은 도심 반경 3km 이내로 축소되면서 공동학군 소속 학교 수는 32개로 줄어들었다.

1977년 또다시 3학군에 소속해 있던 당시 강남구 소재 고교를 분리해 이른바 '8학군'이 만들어졌고 당시 7학군에 소속해 있던 관악구 소재 고교를 분리해 9학군이 신설돼 학군은 총 10개로 늘어났다.

공동학군 범위는 다시 도심 반경 2km로 축소되고 학교 수는 17개로 감소했다.

도심 공동학군은 1980년 폐지되고 9개의 일반학군에 대응해 설정해 놓았던 중학교 학교 군도 함께 폐지됐다. 특정 중학교와 고교를 학교 군으로 묶는 대신 학군을 2~3개의 행정구청 관할 지역과 묶어 설정하게 됐다.

학군 개념이 '학교군'에서 '지역단위'로 바뀌고 각 학군의 추첨 배정 대상자도 해당 중학교 학군 출신에서 해당 학군의 거주자로 바뀌었다.

1998년에는 학군을 11개의 서울 지역교육청 관할 구역으로 재조정하고 지역교육청의 관할 구역과 학군의 경계를 일치시켰다. 학군의 명칭도 지역교육청의 명칭을 따라 북부학군, 중부학군 등으로 변경했다.

1998년 시작된 11개 학군 체제는 지금까지 계속되고 있으나 2010학년도부터 31개 학군으로 세분화된다.